Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SOHLH1Q5JUK2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SOHLH1Q5JUK2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms