Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC18A3Q16572 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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