Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF1CQ15572 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
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