Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPIRE1Q08AE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPIRE1Q08AE8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms