Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RUNX1Q01196 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms