Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD21O60216 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD21O60216 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD21O60216 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD21O60216 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD21O60216 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD21O60216 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms