Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 MDM4-206ENST00000444261 513 ntTSL 29.93□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.951e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 58.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 58.32□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.11e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KRIT1-221ENST00000475770 2411 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.111e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CRLF3-205ENST00000583805 594 ntTSL 47.99□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 57.69□□□□□ -1.181e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 ERI1-202ENST00000518663 698 ntTSL 57.54□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CHMP2A-205ENST00000600006 766 ntTSL 27.24□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 FTSJ1-204ENST00000466371 736 ntTSL 27.06□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LARP1B-209ENST00000508819 1891 ntTSL 57.02□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KATNA1-208ENST00000494504 765 ntTSL 56.43□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 PRPF40A-210ENST00000489741 776 ntTSL 35.77□□□□□ -1.491e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 RTF1-204ENST00000558117 552 ntTSL 45.46□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 NUP205-203ENST00000462316 571 ntTSL 45.2□□□□□ -1.582e-12■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 WDR43-206ENST00000466067 628 ntTSL 25.13□□□□□ -1.591e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CMC1-207ENST00000468330 551 ntTSL 44.88□□□□□ -1.631e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 CEP350-201ENST00000357434 392 ntTSL 1 (best)4.76□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 34.67□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBCK-212ENST00000506615 593 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 24.44□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.741e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 DLG1-226ENST00000485409 656 ntTSL 34□□□□□ -1.771e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KRIT1-214ENST00000445516 561 ntTSL 43.48□□□□□ -1.851e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.941e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 ERI1-204ENST00000520332 750 ntTSL 32.74□□□□□ -1.971e-6■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 MAP3K4-208ENST00000536852 2526 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-7■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SLC22A31-203ENST00000563595 780 ntTSL 321.65■■□□□ 1.068e-12■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 SLC22A31-202ENST00000562916 692 ntTSL 519.6■□□□□ 0.738e-12■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 24.1□□□□□ -1.751e-16■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)3.66□□□□□ -1.821e-16■□□□□ 9.8
SF3B4Q15427 KIF23-205ENST00000558346 1656 ntTSL 1 (best)14.7□□□□□ -0.068e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 AAAS-213ENST00000549450 581 ntTSL 513.12□□□□□ -0.316e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 AAAS-214ENST00000549821 596 ntTSL 311.87□□□□□ -0.516e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.633e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 UCHL5-203ENST00000367450 1355 ntTSL 517.63■□□□□ 0.413e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 UCHL5-209ENST00000420791 1329 ntTSL 52.93□□□□□ -1.943e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP4-213ENST00000477765 284 ntTSL 39.44□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-205ENST00000585015 945 ntTSL 322.1■■□□□ 1.132e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.592e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-203ENST00000458039 836 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 RALBP1-204ENST00000577221 503 ntTSL 38.2□□□□□ -1.12e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 USP48-202ENST00000374730 570 ntTSL 44.24□□□□□ -1.732e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 FXR1-222ENST00000498658 683 ntTSL 29.63□□□□□ -0.876e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.056e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 FXR1-212ENST00000476672 976 ntTSL 26.33□□□□□ -1.46e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SCFD1-208ENST00000553278 795 ntTSL 25.22□□□□□ -1.576e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SCFD1-217ENST00000555953 497 ntTSL 54.24□□□□□ -1.736e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-205ENST00000502594 1163 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.167e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.017e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-212ENST00000513887 578 ntTSL 312.65□□□□□ -0.387e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-215ENST00000631654 620 ntTSL 512.25□□□□□ -0.457e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 HMGCR-203ENST00000442032 268 ntTSL 37.7□□□□□ -1.187e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-210ENST00000512023 817 ntTSL 57.6□□□□□ -1.197e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-211ENST00000512506 727 ntTSL 56.56□□□□□ -1.367e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-209ENST00000511757 1307 ntTSL 26.09□□□□□ -1.437e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 SLC25A36-207ENST00000502866 598 ntTSL 45.5□□□□□ -1.537e-8■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 CEP85-204ENST00000468163 453 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-11■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 PRPF31-209ENST00000498612 881 ntTSL 516.11■□□□□ 0.172e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 311.36□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ALAS2-207ENST00000493869 658 ntTSL 212.46□□□□□ -0.418e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.867e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 27.3□□□□□ -1.247e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ALAS2-204ENST00000455688 664 ntTSL 25.74□□□□□ -1.498e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DNAJC9-203ENST00000469143 362 ntTSL 34.85□□□□□ -1.634e-15■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 34.04□□□□□ -1.767e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.355e-9■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 ATF2-215ENST00000435004 1115 ntTSL 55.47□□□□□ -1.532e-6■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-215ENST00000544041 5444 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.333e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.43e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-221ENST00000567999 578 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.727e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-224ENST00000569061 651 ntTSL 516.68■□□□□ 0.267e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-204ENST00000561784 612 ntTSL 416.14■□□□□ 0.177e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.157e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 PRODH2-206ENST00000591694 728 ntTSL 315.87■□□□□ 0.137e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 KIFC3-224ENST00000565753 473 ntTSL 515.48■□□□□ 0.071e-10■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-217ENST00000566820 549 ntTSL 414.93□□□□□ -0.027e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-203ENST00000561741 580 ntTSL 414.48□□□□□ -0.097e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-209ENST00000562986 468 ntTSL 414.32□□□□□ -0.127e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-223ENST00000568760 579 ntTSL 414.28□□□□□ -0.127e-7■□□□□ 9.7
SF3B4Q15427 DEF8-216ENST00000566079 516 ntTSL 514.17□□□□□ -0.147e-7■□□□□ 9.7
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 704.5 ms