Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms