Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CGGBP1Q9UFW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
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