Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A6Q9P2U8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC17A6Q9P2U8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms