Protein–RNA interactions for Protein: Q9P107

GMIP, GEM-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMIPQ9P107 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GMIPQ9P107 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMIPQ9P107 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms