Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUDCD1Q96RS6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms