Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INPP4AQ96PE3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INPP4AQ96PE3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms