Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE23Q8NDY6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE23Q8NDY6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms