Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL24A1Q17RW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms