Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMAD1Q15797 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMAD1Q15797 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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