Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL19A1Q14993 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL19A1Q14993 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL19A1Q14993 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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