Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RUNX1Q01196 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RUNX1Q01196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms