Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24CP53992 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24CP53992 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24CP53992 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24CP53992 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24CP53992 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC24CP53992 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24CP53992 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms