Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH5P33151 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH5P33151 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH5P33151 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDH5P33151 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH5P33151 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDH5P33151 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms