Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD10P28358 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXD10P28358 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms