Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD21O60216 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD21O60216 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD21O60216 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD21O60216 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD21O60216 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD21O60216 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD21O60216 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms