Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPG2Q9UBF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPG2Q9UBF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms