Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STRA6Q9BX79 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STRA6Q9BX79 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms