Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIRT1Q96EB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIRT1Q96EB6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms