Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ME3Q16798 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ME3Q16798 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ME3Q16798 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ME3Q16798 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ME3Q16798 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
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