Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MCM16YPR046W 546 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RIB5YBR256C 717 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MRPL27YBR282W 441 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 AIM14YGL160W 1713 nt3.8□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 EXO70YJL085W 1872 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 SLI1YGR212W 1407 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RPB2YOR151C 3675 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YDL071CYDL071C 375 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YDR535CYDR535C 501 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YER034WYER034W 558 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 COG2YGR120C 789 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 RPB3YIL021W 957 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 GCD14YJL125C 1152 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 MET14YKL001C 609 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 AUR1YKL004W 1206 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 AIM26YKL037W 357 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 NYV1YLR093C 762 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 DLT1YMR126C 1029 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 POP7YBR167C 423 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 BUD5YCR038C 1929 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 PIM1YBL022C 3402 nt3.79□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 IZH1YDR492W 951 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YGR115CYGR115C 780 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 COX19YLL018C-A 297 nt3.78□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 PAM18YLR008C 507 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 SUR1YPL057C 1149 nt3.78□□□□□ -1.8 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPS11BYBR048W 471 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 PPT2YPL148C 522 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 ERV15YBR210W 429 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 POF1YCL047C 777 nt3.78□□□□□ -1.8
PUF2Q12221 GAL11YOL051W 3246 nt3.78□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 NOC2YOR206W 2133 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SPT23YKL020C 3249 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RPS13YDR064W 456 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YGL109WYGL109W 324 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YGL242CYGL242C 546 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 ERV29YGR284C 933 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 CAP2YIL034C 864 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YJL147CYJL147C 1149 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YJR128WYJR128W 360 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 AHP1YLR109W 531 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YLR428CYLR428C 345 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SEC14YMR079W 915 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 FOL3YMR113W 1284 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YMR187CYMR187C 1296 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 MPP6YNR024W 561 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RRG7YOR305W 729 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 CUP9YPL177C 921 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GAC1YOR178C 2382 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 VMA1YDL185W 3216 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 DSS1YMR287C 2910 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SLA1YBL007C 3735 nt3.77□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TRM12YML005W 1389 nt3.76□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 PUB1YNL016W 1362 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YDR131CYDR131C 1671 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 PRS5YOL061W 1491 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 WBP1YEL002C 1293 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YGL138CYGL138C 1038 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GTR2YGR163W 1026 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 REC104YHR157W 549 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 BUD19YJL188C 309 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YPT52YKR014C 705 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 SRP40YKR092C 1221 nt3.76□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR217WYLR217W 324 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GAL7YBR018C 1101 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TUM1YOR251C 915 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 TRS20YBR254C 528 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 BCS1YDR375C 1371 nt3.76□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 VPS27YNR006W 1869 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 GRS2YPR081C 1857 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 ERG9YHR190W 1335 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 CDC45YLR103C 1953 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YCR108CYCR108C 192 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 THP2YHR167W 786 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RSM25YIL093C 795 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 APQ13YJL075C 417 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 NIS1YNL078W 1224 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YBR071WYBR071W 636 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 MRPL51YPR100W 423 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 CEX1YOR112W 2286 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 NHX1YDR456W 1902 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 MNR2YKL064W 2910 nt3.75□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RAD18YCR066W 1464 nt3.74□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG26YLR189C 3597 nt3.74□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG2YNL242W 4779 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 RDS1YCR106W 2499 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 OCA6YDR067C 675 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 MTC7YEL033W 420 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YER076CYER076C 909 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 PGD1YGL025C 1194 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 VPS45YGL095C 1734 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YGR051CYGR051C 324 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YVH1YIR026C 1095 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 AIM22YJL046W 1230 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 STE18YJR086W 333 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YML053CYML053C 639 nt3.74□□□□□ -1.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 ECM16YMR128W 3804 nt3.74□□□□□ -1.81
PUF2Q12221 YNR071CYNR071C 1029 nt3.74□□□□□ -1.81
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