Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	DAL2	YIR029W	1032 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YPL088W	YPL088W	1029 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YPP1	YGR198W	2454 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3.03	□□□□□ -1.92
ATG12	P38316	YOR365C	YOR365C	2112 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YPR148C	YPR148C	1308 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	CTH1	YDR151C	978 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SEM1	YDR363W-A	270 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SCM4	YGR049W	564 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	CIR1	YGR207C	786 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YHL045W	YHL045W	348 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YLR297W	YLR297W	390 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	CAF20	YOR276W	486 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	DIM1	YPL266W	957 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ROG1	YGL144C	2058 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ACA1	YER045C	1470 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	MSS4	YDR208W	2340 nt		3.02	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ORC1	YML065W	2745 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	NHP10	YDL002C	612 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YHL005C	YHL005C	393 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	THP2	YHR167W	786 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SFH1	YLR321C	1281 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YMR310C	YMR310C	954 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	IZH2	YOL002C	954 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	HEH2	YDR458C	1992 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	POL2	YNL262W	6669 nt		3.01	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ETP1	YHL010C	1758 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	BUD4	YJR092W	4344 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RMD5	YDR255C	1266 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YDR355C	YDR355C	303 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YDR431W	YDR431W	312 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SPT15	YER148W	723 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SMA2	YML066C	1110 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	PRE8	YML092C	753 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ATG3	YNR007C	933 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	CYC2	YOR037W	1101 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	GRX1	YCL035C	333 nt		3	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	ALG8	YOR067C	1734 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	TAM41	YGR046W	1158 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YGR126W	YGR126W	693 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	DLS1	YJL065C	504 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SDH3	YKL141W	597 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YOR263C	YOR263C	408 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	TOP1	YOL006C	2310 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	MAL12	YGR292W	1755 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	MAL32	YBR299W	1755 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	AEP2	YMR282C	1743 nt		2.99	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YDR089W	YDR089W	2610 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RRP8	YDR083W	1179 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	TLG1	YDR468C	675 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	AML1	YGR001C	747 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RPL6A	YML073C	531 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	TEX1	YNL253W	1269 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YOL024W	YOL024W	519 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	STP1	YDR463W	1560 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SUC2	YIL162W	1599 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RPN1	YHR027C	2982 nt		2.98	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	EBS1	YDR206W	2655 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SIN4	YNL236W	2925 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	BCH1	YMR237W	2175 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	FLO9	YAL063C	3969 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	LSM1	YJL124C	519 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	GPI14	YJR013W	1212 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	SEC14	YMR079W	915 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	RLP7	YNL002C	969 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	GPI2	YPL076W	843 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YSA1	YBR111C	696 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	BYE1	YKL005C	1785 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	FRE4	YNR060W	2160 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	FUN30	YAL019W	3396 nt		2.97	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	YPL216W	YPL216W	3309 nt		2.96	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	COM2	YER130C	1332 nt		2.96	□□□□□ -1.93
ATG12	P38316	MIP6	YHR015W	1980 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PMR1	YGL167C	2853 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YIL169C	YIL169C	2988 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	NMA111	YNL123W	2994 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	UBP14	YBR058C	2346 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	CCM1	YGR150C	2595 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MGT1	YDL200C	567 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PPX1	YHR201C	1194 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MRP8	YKL142W	660 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PBA1	YLR199C	831 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RPN13	YLR421C	471 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SPO20	YMR017W	1194 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YMR306C-A	YMR306C-A	390 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YNL234W	YNL234W	1281 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MIG1	YGL035C	1515 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SKN7	YHR206W	1869 nt		2.96	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	KAP95	YLR347C	2586 nt		2.96	□□□□□ -1.94

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