Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.7	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	STE24	YJR117W	1362 nt		3.7	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.7	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.7	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	MNT4	YNR059W	1743 nt		3.7	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	BYE1	YKL005C	1785 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	SPT2	YER161C	1002 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PRP18	YGR006W	756 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YGR064W	YGR064W	369 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YGR168C	YGR168C	1131 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	SNX4	YJL036W	1272 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RIF2	YLR453C	1188 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RAS1	YOR101W	930 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YPL035C	YPL035C	348 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	THR4	YCR053W	1545 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.69	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PKP2	YGL059W	1476 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RPS25A	YGR027C	327 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	CAP2	YIL034C	864 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YOL019W-A	YOL019W-A	153 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ATG34	YOL083W	1239 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ICS2	YBR157C	768 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.68	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	STU1	YBL034C	4542 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	FAP7	YDL166C	594 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	DET1	YDR051C	1005 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ARI1	YGL157W	1044 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ARG3	YJL088W	1017 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YLR416C	YLR416C	399 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	snR11	snR11	258 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	CSH1	YBR161W	1131 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.67	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	ITT1	YML068W	1395 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	MGT1	YDL200C	567 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PAU10	YDR542W	363 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	MRM2	YGL136C	963 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PAU11	YGL261C	363 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PAU13	YHL046C	363 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	PAU4	YLR461W	363 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RAD14	YMR201C	1116 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	HHF1	YBR009C	312 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	DGA1	YOR245C	1257 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	FDH2	YPL275W	711 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YBR089W	YBR089W	600 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RRP7	YCL031C	894 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	RNT1	YMR239C	1416 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	VIP1	YLR410W	3441 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.66	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	VPS17	YOR132W	1656 nt		3.65	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	MSM1	YGR171C	1728 nt		3.65	□□□□□ -1.82
RPC53	P25441	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PFS1	YHR185C	714 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	TPM1	YNL079C	600 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	MCT1	YOR221C	1083 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PIN3	YPR154W	648 nt		3.65	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	WHI3	YNL197C	1986 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SNU23	YDL098C	585 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YDR124W	YDR124W	975 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SPT4	YGR063C	309 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	MRP8	YKL142W	660 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	OCA2	YNL056W	594 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RRP36	YOR287C	903 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	UBS1	YBR165W	834 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.64	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	OPI6	YDL096C	327 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PSF1	YDR013W	627 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	BUD26	YDR241W	288 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YGR114C	YGR114C	390 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SWD2	YKL018W	990 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RNH203	YLR154C	333 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YML090W	YML090W	387 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	CPR8	YNR028W	927 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PRP22	YER013W	3438 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SEC27	YGL137W	2670 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	STU2	YLR045C	2667 nt		3.63	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	DUN1	YDL101C	1542 nt		3.62	□□□□□ -1.83

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