Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00271P0C7V0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00271P0C7V0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms