Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAD1O00515 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAD1O00515 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LAD1O00515 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAD1O00515 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAD1O00515 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAD1O00515 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAD1O00515 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms