Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3KRW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3KRW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3KRW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3KRW8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3KRW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3KRW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms