Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GVL5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVL5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms