Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF12Q9Y4X4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLF12Q9Y4X4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms