Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXW11Q9UKB1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXW11Q9UKB1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms