Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SARS2Q9NP81 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SARS2Q9NP81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms