Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEBOXQ9HB31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEBOXQ9HB31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms