Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM42Q9BTD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM42Q9BTD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM42Q9BTD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms