Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA3CQ99985 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA3CQ99985 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms