Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIRT1Q96EB6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIRT1Q96EB6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SIRT1Q96EB6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms