Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf3Q8WVX3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf3Q8WVX3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms