Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYNE4Q8N205 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYNE4Q8N205 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms