Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PPARGC1BQ86YN6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPARGC1BQ86YN6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPARGC1BQ86YN6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms