Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC62Q6P9F0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC62Q6P9F0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms