Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 TEF2YBR118W 1377 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 TSR1YDL060W 2367 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 UBC1YDR177W 648 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RMT2YDR465C 1239 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 RPS2YGL123W 765 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 MRPL9YGR220C 810 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 SPC1YJR010C-A 285 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 COQ5YML110C 924 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 NAT3YPR131C 588 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 YPR170CYPR170C 336 nt5.84□□□□□ -1.47
SRF1Q12516 NGR1YBR212W 2019 nt5.84□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RAD28YDR030C 1521 nt5.84□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 MSA1YOR066W 1890 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RCK2YLR248W 1833 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 HXT4YHR092C 1731 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 ASA1YPR085C 1332 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RSM24YDR175C 960 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 MIG2YGL209W 1149 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 STM1YLR150W 822 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 TIF11YMR260C 462 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YMR310CYMR310C 954 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 UBC4YBR082C 447 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 APD1YBR151W 951 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YBR178WYBR178W 375 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YJR098CYJR098C 1971 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 MUD2YKL074C 1584 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 FAR8YMR029C 1572 nt5.83□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 DSE1YER124C 1722 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 VAN1YML115C 1608 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 HRP1YOL123W 1605 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YER085CYER085C 522 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YHI9YHR029C 885 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 CTF8YHR191C 402 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 BLI1YKL061W 342 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 OCA2YNL056W 594 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 TPM1YNL079C 600 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 AVT4YNL101W 2142 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 NSL1YPL233W 651 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 ATM1YMR301C 2073 nt5.82□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YDR444WYDR444W 2064 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 BDP1YNL039W 1785 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 PMT5YDL093W 2232 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 snR85snR85 171 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 NHP2YDL208W 471 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YRB1YDR002W 606 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YKT6YKL196C 603 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 BSC3YLR465C 309 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 CDC14YFR028C 1656 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 ACS2YLR153C 2052 nt5.81□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 AFR1YDR085C 1863 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 MOH1YBL049W 417 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YOR392WYOR392W 444 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 SEO1YAL067C 1782 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 NGG1YDR176W 2109 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 SSL1YLR005W 1386 nt5.8□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YEL020CYEL020C 1683 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 MPH2YDL247W 1830 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RFU1YLR073C 603 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YMR315WYMR315W 1050 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 HCH1YNL281W 462 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 ARG81YML099C 2643 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 SFB3YHR098C 2790 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 EFT2YDR385W 2529 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 EFT1YOR133W 2529 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 THP1YOL072W 1368 nt5.79□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 PKP2YGL059W 1476 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YKR078WYKR078W 1758 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RNH203YLR154C 333 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 RPL13BYMR142C 600 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YNL235CYNL235C 432 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YNG1YOR064C 660 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 XKS1YGR194C 1803 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YKL075CYKL075C 1353 nt5.78□□□□□ -1.48
SRF1Q12516 YPR148CYPR148C 1308 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 NMD3YHR170W 1557 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 PKC1YBL105C 3456 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 SEN54YPL083C 1404 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 POP1YNL221C 2628 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 YPD1YDL235C 504 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 RGI1YER067W 486 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 YER084WYER084W 387 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 YER175W-AYER175W-A 165 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 UNG1YML021C 1080 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 MCM1YMR043W 861 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 IRC16YPR038W 360 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 MCH4YOL119C 1506 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 ENP2YGR145W 2124 nt5.77□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 CEF1YMR213W 1773 nt5.76□□□□□ -1.49
SRF1Q12516 YDR413CYDR413C 576 nt5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.4 ms