Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 RSC58YLR033W 1509 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RRP14YKL082C 1305 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YDR431WYDR431W 312 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 LRS4YDR439W 1044 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 MAG1YER142C 891 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPS25AYGR027C 327 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YLR416CYLR416C 399 nt3.56□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 THR4YCR053W 1545 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RRP42YDL111C 798 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YDR230WYDR230W 348 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 API2YDR525W 330 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 IME1YJR094C 1083 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 MRPL3YMR024W 1173 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 HHF1YBR009C 312 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 STT4YLR305C 5703 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 MSK1YNL073W 1731 nt3.55□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YNR066CYNR066C 1311 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RAD55YDR076W 1221 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YFL051CYFL051C 483 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ARI1YGL157W 1044 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SWD2YKL018W 990 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 MRP8YKL142W 660 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YPT7YML001W 627 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SHH3YMR118C 591 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPN8YOR261C 1017 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YNR065CYNR065C 3351 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 VPS17YOR132W 1656 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PKP2YGL059W 1476 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SMC3YJL074C 3693 nt3.54□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 SST2YLR452C 2097 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ITT1YML068W 1395 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 TMA17YDL110C 453 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 GRX2YDR513W 432 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 VFA1YER128W 612 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YHR097CYHR097C 1101 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YIL161WYIL161W 708 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPL13BYMR142C 600 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 YOR131CYOR131C 657 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 PLP2YOR281C 861 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ATG29YPL166W 642 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ICS2YBR157C 768 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 RPN2YIL075C 2838 nt3.53□□□□□ -1.84
CIK1Q01649 ERG5YMR015C 1617 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 BUD25YER014C-A 462 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGL138CYGL138C 1038 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 SCM4YGR049W 564 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGR114CYGR114C 390 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGR126WYGR126W 693 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 MPC3YGR243W 441 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PAN5YHR063C 1140 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PRM4YPL156C 855 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 CSH1YBR161W 1131 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PHO81YGR233C 3537 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 HRD1YOL013C 1656 nt3.52□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 VIP1YLR410W 3441 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 XRN1YGL173C 4587 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 SMT3YDR510W 306 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 USE1YGL098W 738 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 HIS5YIL116W 1158 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 RNH203YLR154C 333 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 VAM10YOR068C 345 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YOR238WYOR238W 912 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 MTL1YGR023W 1656 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 RRP5YMR229C 5190 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGR237CYGR237C 2358 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PTM1YKL039W 1572 nt3.51□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 ARO1YDR127W 4767 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YDL228CYDL228C 642 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 NKP1YDR383C 717 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 RPS23AYGR118W 438 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PFS1YHR185C 714 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 UTP11YKL099C 753 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 COQ9YLR201C 783 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 TVP18YMR071C 504 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 RPS7AYOR096W 573 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 BAG7YOR134W 1230 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 RPS23BYPR132W 438 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 SLX1YBR228W 915 nt3.5□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YMR018WYMR018W 1545 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 AIP1YMR092C 1848 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 FAP7YDL166C 594 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YDL242WYDL242W 354 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGR168CYGR168C 1131 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YKT6YKL196C 603 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 GSP1YLR293C 660 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YBL028CYBL028C 321 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 ATG34YOL083W 1239 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 snR11snR11 258 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PNO1YOR145C 825 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 SPH1YLR313C 1593 nt3.49□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 SUP45YBR143C 1314 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 EXO70YJL085W 1872 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YDR124WYDR124W 975 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 PEX10YDR265W 1014 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 GLC3YEL011W 2115 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 YGR051CYGR051C 324 nt3.48□□□□□ -1.85
CIK1Q01649 ARG3YJL088W 1017 nt3.48□□□□□ -1.85
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