Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PABPC1P11940 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PABPC1P11940 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms