Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SPAG9O60271 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SPAG9O60271 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SPAG9O60271 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
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