Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHB5Q9Y5E4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms