Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHBDD3Q9Y3P4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms